• Home
  • Chimica
  • Astronomia
  • Energia
  • Natura
  • Biologia
  • Fisica
  • Elettronica
  •  science >> Scienza >  >> Biologia
    Il nuovo database online mette a fuoco il genoma utilizzando la struttura molecolare

    Un anello a forcina da un pre-mRNA. Sono evidenziate le basi azotate (verde) e lo scheletro ribosio-fosfato (blu). Nota che questo è un singolo filamento di RNA che si ripiega su se stesso. Credito:Vossman/ Wikipedia

    I ricercatori della Iowa State University hanno creato un database online accessibile che mette a fuoco i dati genomici critici con un solo clic del mouse.

    In un articolo pubblicato oggi sulla rivista Rapporti scientifici , un team di ricercatori della Iowa State University ha presentato un nuovo database che consente agli scienziati di accedere rapidamente alle informazioni sulle strutture dell'RNA codificate all'interno del genoma umano. Il database è liberamente accessibile a chiunque sul web, dove consente agli scienziati di studiare le funzioni e la struttura dell'RNA con maggiore velocità e facilità rispetto al passato. Ciò contribuirà a facilitare la ricerca di base sulla biologia umana e potrebbe aprire la strada a nuovi trattamenti medici mirati all'RNA, disse Walter Moss, un assistente professore nel dipartimento di biochimica di Roy J. Carver, Biofisica e Biologia Molecolare.

    RNA, abbreviazione di acidi ribonucleici, sono catene molecolari che vengono trascritte, o copiato, dal genoma. Gli RNA possono essere vettori di informazioni, agendo come intermedi tra DNA e proteine, o come molecole funzionanti in modo indipendente che mediano molti processi regolatori critici. A differenza del DNA, L'RNA può "ripiegarsi" su se stesso per formare strutture che rivaleggiano con le proteine ​​nella loro complessità. Questo ripiegamento gioca un ruolo chiave nella funzione dell'RNA, quindi ottenere informazioni strutturali sull'RNA può fornire importanti informazioni sulla nostra comprensione di come funzionano gli organismi, disse il muschio.

    "L'RNA è fondamentale per comprendere la biologia, e i progressi nella tecnologia di sequenziamento hanno portato a un'esplosione nell'elenco degli RNA potenzialmente funzionali, " Egli ha detto.

    Per esempio, mentre solo il 2% circa dei 3,5 miliardi di paia di basi del DNA umano codifica per proteine, più del 70% è trascritto nell'RNA. Comprendere le funzioni di questo oceano di RNA inesplorato rappresenta una sfida scientifica fondamentale, e il nuovo database fornisce strumenti cruciali per tracciarlo, disse il muschio.

    Muschio, insieme allo studente laureato Ryan Andrews e al direttore della ricerca IT Levi Baber, ha frammentato l'intero genoma umano in oltre 154 milioni di finestre sovrapposte e calcolato una serie di parametri utili per comprendere come si piega l'RNA.

    "Chiunque nel mondo può ora recuperare con un clic ciò che una volta richiedeva ore di calcoli per determinare, " ha detto Andrea.

    terapie dell'RNA, un nuovo approccio in medicina in cui l'RNA è preso di mira con farmaci piuttosto che con proteine, mostra una grande promessa, e il database strutturale dettagliato nella pubblicazione fornisce un enorme archivio di potenziali contatti terapeutici, disse il muschio.


    © Scienza https://it.scienceaq.com