* fosfato di calcio (ca₃ (po₄) ₂) :Ciò fornisce gli ioni di calcio e fosfato che formano la struttura di base del minerale.
* idrossido di calcio (ca (OH) ₂) :Ciò contribuisce con gli ioni idrossido (OH⁻) che danno all'idrossiapatite il suo nome e proprietà uniche.
Sebbene questi siano i componenti principali, le quantità di tracce di altri elementi, come il fluoruro, il cloruro e il carbonato, possono essere incorporati nella struttura dell'idrossiapatite.