La cromatografia si basa sulla separazione dei componenti in base alle loro differenze in affinità per le fasi stazionarie e mobili.

* Fase stazionaria: Questo è il materiale solido o viscoso su cui viene passata la miscela.

* Fase mobile: Questo è il fluido (liquido o gas) che trasporta la miscela attraverso la fase stazionaria.

Meccanismo di separazione:

* Conservazione differenziale: Componenti diversi nella miscela interagiranno con la fase stazionaria in modo diverso. Alcuni si legaranno più fortemente, trascorrendo più tempo adsorbiti, mentre altri interagiranno di meno e trascorreranno più tempo nella fase mobile. Questa differenza nei tempi di ritenzione porta alla separazione.

Se due particelle hanno la stessa velocità, significa che interagiscono in modo identico con la fase stazionaria. Trascorrono pari quantità di tempo adsorbite e nella fase mobile, con conseguente alcuna separazione. Avrebbero viaggiato insieme attraverso la colonna di cromatografia, comportandosi efficacemente come un singolo componente.

In sostanza, la cromatografia si basa su variazioni dei punti di forza di interazione per raggiungere la separazione. Se tali variazioni sono assenti (cioè velocità uguali), la separazione diventa impossibile.