*Il gruppo di ricerca identifica un nuovo fenomeno che porta a una migliore comprensione del metodo*
Il sequenziamento del DNA è una parte fondamentale della biologia moderna e viene utilizzato in molti contesti come la diagnostica medica, la scienza forense e la biologia evoluzionistica. Recentemente sono emerse molte nuove tecniche per il sequenziamento del DNA, che offrono molti vantaggi rispetto al sequenziamento Sanger precedentemente dominante. Queste nuove tecniche impiegano metodi più veloci ed economici, spesso consentendo il sequenziamento di frammenti di DNA nel giro di poche ore. Il sequenziamento dei nanopori utilizza nanopori biologici o sintetici per forzare singole molecole di DNA o RNA attraverso un poro proteico. Questo processo può quindi essere utilizzato per stabilire la sequenza di nucleotidi lungo un filamento di DNA o RNA.
Un nuovo studio del Dr. Sebastian Getfert, del Dr. Jörg Bewarder, entrambi post-doc presso il Dipartimento di Fisica, e del Professor Ulrich Rant, capo del dipartimento, ha identificato un nuovo fenomeno che influenza il rilevamento dei nanopori e migliorerà quindi la comprensione e applicazione di questa tecnologia.
Attualmente, il rilevamento dei nanopori nei pori biologici si basa sul rallentamento controllato della traslocazione delle molecole di DNA applicando un campo elettrico sul nanoporo. I ricercatori mostrano attraverso simulazioni di dinamica molecolare multiscala che, in presenza di questo campo, parti del DNA possono uscire temporaneamente dal poro e disperdersi nel solvente, il che influenza il segnale del DNA misurato e può portare a difficoltà nell’interpretazione dei dati.
Getfert e Rant:"Il rilevamento dei nanopori è una tecnologia altamente promettente e il nostro lavoro contribuisce alla comprensione fondamentale del processo di rilevamento dei nanopori, consentendo in definitiva agli scienziati di sviluppare e ottimizzare ulteriormente il metodo".
Lo studio del dipartimento di fisica è stato pubblicato recentemente sulla rinomata rivista scientifica Nature Communications.
