Nettuno aveva un grande punto oscuro , simile al grande punto rosso di Giove, che era una tempesta enorme visibile nella sua atmosfera. Tuttavia, a differenza della tempesta di Giove, che è persistita per secoli, il grande punto oscuro di Nettuno è scomparso nel 1994.

Più tardi, un nuovo punto oscuro apparve su Nettuno, ma alla fine si dissipò. Gli scienziati credono che questi punti oscuri siano probabilmente grandi tempeste nell'atmosfera di Nettuno.