Un pomodoro è acido. Il pH di un pomodoro varia tipicamente da 4,0 a 4,5, che è inferiore al pH neutro di 7. Ciò significa che i pomodori hanno una maggiore concentrazione di ioni idrogeno (H+) rispetto agli ioni idrossido (OH-), rendendoli acidi. L'acidità dei pomodori è dovuta principalmente alla presenza di acidi organici come acido citrico, acido malico e acido ossalico, tra gli altri. Questi acidi contribuiscono al sapore aspro dei pomodori.