Un esempio dei tipi di strutture cristalline 3-D incluse in un rilancio di Crystal Lattice Structures, un venerabile "libro di cucina" online per chimici. Credito:Cormac Toher, Duke University
In risposta alla grande richiesta, gli scienziati dei materiali della Duke University hanno riportato in vita un libro di cucina online di strutture cristalline iniziato quando il World Wide Web era Netscape Navigator e HTML 1.0.
Nel 1995, Michael Mehl, poi uno scienziato presso il Naval Research Laboratory degli Stati Uniti, iniziato a raccogliere, catalogazione e condivisione di informazioni sulle strutture cristalline su un sito Web di base per i colleghi.
I ricercatori avevano bisogno di un catalogo di riferimento per guidare i loro sforzi perché i cristalli formano centinaia di strutture diverse in natura. I chimici usano i cristalli come pratici blocchi di costruzione per nuovi materiali a causa della loro rigidità, forme molecolari ordinate, che aiutano a determinare le proprietà di un materiale.
sito web di Mehl, chiamate strutture reticolari di cristallo, fornito informazioni dettagliate che, mentre disponibile da altre fonti, era più utile ai ricercatori che non avevano familiarità con le convenzioni cristallografiche. Se i database cristallini fossero libri di cucina e ogni struttura cristallina una ricetta, i ricercatori avevano scritto altri riferimenti adatti a chef francesi affermati con una formazione specializzata. Strutture a reticolo di cristallo, d'altra parte, era per il tuo cuoco casalingo medio.
"La biblioteca ha mostrato come la cristallografia si relaziona ai cristalli nel mondo reale, " ha spiegato Mehl, ora all'Accademia Navale degli Stati Uniti. "Ha anche fornito un'ampia panoramica delle strutture viste sperimentalmente, che è sempre un buon punto di partenza per cercare qualcosa di nuovo."
Mehl ha chiuso il sito web nel 2010, però, dovuto in parte agli aggiornamenti di sicurezza effettuati presso l'NRL, e perché la crescita casuale del sito Web in oltre 15 anni ha reso la sua organizzazione inutilmente complicata e le sue voci non standardizzate.
"C'erano molte persone nella comunità che chiedevano dove fosse finito il database e se potesse essere ripristinato o meno, " disse Stefano Curtarolo, professore di ingegneria meccanica e scienza dei materiali alla Duke. "Abbiamo deciso di mettere insieme tutte le informazioni in un documento e anche di riportare il sito Web in una versione più robusta e open source".
Con l'aiuto di Mehl, Curtarolo e il suo team hanno resuscitato Crystal Lattice Structures, il lancio di un nuovo e migliorato catalogo online e la pubblicazione di un documento contenente tutti i suoi dati (il primo di una raccolta più lunga). Il documento è apparso online il 22 maggio in Scienza computazionale dei materiali .
La carta, che ha richiesto più di un anno per essere compilato, contiene 288 voci per varie strutture cristalline. Ogni voce contiene dati sulla simmetria della struttura, le sue proprietà cristalline e la forma di una cella elementare. Contiene anche equazioni matematiche generiche che descrivono la posizione di ciascun atomo, piuttosto che fornire tali informazioni in una forma specializzata come fanno in genere altri database.
"Avere scritte le equazioni per i posizionamenti atomici offre maggiore flessibilità per includere lievi variazioni e per regolare in modo specifico ogni struttura, " ha detto Cormac Toher, assistente professore di ingegneria meccanica e scienza dei materiali alla Duke. "Avremo anche un visualizzatore 3D delle strutture nella parte superiore di ogni voce in modo che le persone possano vedere le strutture da diverse angolazioni".
Rendere il nuovo sito ancora più robusto, ogni voce è direttamente collegata alla libreria AFLOW del Duke Center for Materials Genomics, un database online di composti a due e tre elementi che consente agli utenti di prevedere le proprietà di materiali ancora da scoprire. Con l'incorporazione della nuova banca dati, gli utenti possono semplicemente scegliere quali atomi elementari posizionare in quali posizioni in una qualsiasi delle 288 strutture cristalline, e il programma calcolerà le probabili proprietà del materiale risultante.
"Dovevamo decidere in quale formato presentare le informazioni, ottenere tutti i dati, e 800 pagine dopo, assicurati che non ci siano errori, "ha detto David Hicks, uno studente laureato nel laboratorio di Curtarolo. "E poi l'implementazione di tutto all'interno di AFLOW ha richiesto altri 288 file di codice C++. È stato un sacco di lavoro, ma pensiamo che sarà una risorsa molto utile per la comunità".