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    Come produrre alberi filogenetici

    Un albero filogenetico è una rappresentazione grafica delle relazioni evolutive che dimostra come gli organismi potrebbero aver potuto discostarsi da un antenato comune. In precedenza, questo è stato fatto attraverso il confronto tra anatomia e fisiologia di organismi viventi e fossili, ma ora vengono comunemente utilizzate informazioni genetiche tratte da sequenze di nucleotidi del DNA. Organismi con poche somiglianze possono essere trovati sui "rami" separati di un albero filogenetico e quelli con specifici punti in comune si troverebbero su "ramoscelli" dello stesso ramo. Un albero filogenetico è un metodo per comprendere le specie e i cambiamenti evolutivi negli organismi.

    Selezionare un organismo modello per il confronto delle relazioni. Questo può essere fatto con una sequenza di specie, razza o nucleotide che rappresenta un organismo. Un organismo di esempio potrebbe essere una mucca. Il resto dell'albero mostrerebbe quanto una mucca sia strettamente correlata ad altri organismi basati su tratti genetici.

    Scegli un outgroup. Un outgroup è un organismo meno strettamente correlato o una sequenza nucleotidica molto diversa. Se l'organismo modello è una mucca, un possibile outgroup potrebbe essere un pesce. Più diversi sono i due organismi, più in basso sull'albero filogenetico sarà il loro punto di divisione divergente. Il tempo è rappresentato con la data più vecchia nella parte inferiore del grafico e il giorno presente nella parte superiore del grafico. La disposizione dei rami mostra approssimativamente quando nel passato un tratto evolutivo poteva cambiare un organismo ancestrale in diverse specie.

    Determina un insieme di caratteristiche da usare per il confronto. Gli esempi includono "ha quattro zampe", "mastica il cud", "dà vita" o "cresce i capelli". Le sequenze nucleotidiche sono solo rappresentazioni alfabetiche del DNA che determinano le caratteristiche, quindi un'altra opzione sarebbe: "contiene la sequenza ATGGACACGGA."

    Dividi organismi sulla base delle caratteristiche. Quando un organismo non contiene il tratto desiderato, un ramo è fatto nell'albero filogenetico. Per il carattere "ha quattro zampe", mucche, pecore e cervi si troverebbero su un ramo, mentre i pesci si troverebbero su un ramo separato. Incolla l'immagine o la sequenza di una mucca nell'angolo superiore del tabellone e il pesce nell'angolo opposto e disegna due linee da loro alla base del foglio in una forma a V intersecante.

    Continua a separare organismi modello o sequenze nucleotidiche fino a quando ogni esempio ha una singola separazione dal ramo in un ramoscello. La caratteristica "ha lana" separerebbe le pecore dai cervi e le mucche su un ramo singolare. Posiziona l'immagine della pecora vicino all'immagine del pesce e disegna una linea che si connette a forma di V fino al ramo della mucca. Usando la caratteristica "ha una coda soffice" sarebbe demarcare la mucca dai cervi. Incolla l'immagine del cervo tra la mucca e la pecora e disegna un'altra linea in una forma a V che si interseca sopra le linee di pesce e di pecora. Quando ogni specie ha un solo ramo, l'albero filogenetico è stato completato.

    Suggerimento

    Scegli un insieme finito di organismi o sequenze. Scegli caratteristiche o sequenze che dividono gli organismi in gruppi separati. Avere più supporti caratteristici per dimostrare le relazioni tra organismi.

    Avviso

    Il posizionamento filogenetico può essere discusso sulla base di molte caratteristiche, e per le scelte di posizionamento è necessario un ampio supporto. Equazioni matematiche possono essere necessarie per dimostrare la probabilità statistica di cambiamenti evolutivi. La probabilità di divergenza sul piano genetico lascia spazio a possibili inesattezze negli alberi filogenetici.

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