Esistono molti tipi diversi di funghi che crescono in tutto il mondo in un'ampia varietà di ambienti e condizioni di vita. I funghi non hanno le strutture complesse delle piante, che consentono alle piante di utilizzare la luce solare in modo efficiente e di produrre grandi quantità della propria energia. Invece, i funghi devono fare affidamento su metodi più flessibili per assorbire i gas necessari e ottenere la loro energia dall'ambiente circostante.
Metodi di acquisizione di gas sotterranei

I funghi fanno la maggior parte della loro crescita sotterranea, lontano dalla luce solare e atmosfera aperta dove crescono le piante. Tuttavia, i funghi respirano anche come altri tipi di piante, nonostante la loro esistenza sotterranea. Ci riescono attraverso i pori naturali del suolo. Il suolo è composto da molte sostanze diverse, tra cui particelle di minerali, acqua, radici e organismi come i funghi. Tra queste particelle ci sono piccole sacche d'aria. Quest'aria, come l'aria nell'atmosfera superiore, contiene tutto ciò che le piante devono assorbire dall'aria, in particolare l'ossigeno.

Se dovessi rimuovere un intero campione di funghi dal terreno, noteresti un gran numero di radici filiformi che compongono la maggior parte del corpo del fungo. Queste strutture dei capelli sono conosciute come ife e possono essere così piccole che è difficile distinguerle dal terreno attorno al fungo. Queste ife possono crescere in spazi che le radici delle piante non possono e possono assorbire l'ossigeno dalle microscopiche tasche nel terreno stesso, scambiando gas con il suolo anziché con l'atmosfera. Quando un fungo produce funghi o altre escrescenze, scambiano gas con l'atmosfera proprio come fanno le piante.
Relazioni parassitarie

Alcuni tipi di funghi crescono in relazioni molto specifiche con solo forme di vita. Il fungo micorrizico, ad esempio, vive su un albero e coltiva parassiti mico-eterofiti. Il fungo assorbe i nutrienti dall'albero e li passa sulla crescita del parassita, portando con sé i nutrienti necessari. Questo tipo di scambio di particelle è raro e si applica solo a determinate relazioni di funghi.
Eccezioni

Alcuni tipi di gas di scambio di funghi si basano sul loro ambiente. Il lievito, ad esempio, conduce la respirazione in base alla presenza di ossigeno. Se sono disponibili ossigeno e aria, il lievito assorbe ossigeno attraverso piccoli pori nella respirazione aerobica. Se non è presente ossigeno, il lievito esegue la respirazione anaerobica, assorbendo i nutrienti che può e causando la fermentazione nel processo.