Legame dell'acido nucleico :Le molecole di EtBr hanno una struttura planare che consente loro di intercalare tra le basi impilate di DNA o RNA a doppio filamento. Questo processo di intercalazione fa sì che le molecole di DNA o RNA diventino fluorescenti quando esposte alla luce UV.
Emissione di fluorescenza :Quando l'EtBr si lega agli acidi nucleici ed è esposto alla luce UV, assorbe l'energia UV ed emette luce visibile nella regione rosso-arancione dello spettro. Questa emissione di luce è ciò che consente la visualizzazione di frammenti di DNA o RNA durante l'elettroforesi su gel.
Sensibilità :L'EtBr è altamente sensibile e utilizzando questo colorante è possibile rilevare anche piccole quantità di acidi nucleici. Questa sensibilità è fondamentale per rilevare e analizzare campioni di DNA o RNA a bassa concentrazione.
Rilevamento e visualizzazione :Dopo l'elettroforesi, il gel di agarosio contenente i frammenti di DNA o RNA separati viene colorato con la soluzione di EtBr. Il gel viene quindi posto sotto una fonte di luce UV, come un transilluminatore. Le bande degli acidi nucleici colorate con EtBr appaiono come bande fluorescenti rosso-arancio brillanti su uno sfondo scuro.
Documentazione :Le bande fluorescenti possono essere visualizzate e documentate utilizzando la fotografia o sistemi di imaging digitale. Ciò consente ai ricercatori di acquisire e analizzare i risultati dell'elettroforesi.
Tuttavia, è importante notare che l'EtBr è un potenziale mutageno e può causare danni alle cellule e al DNA. Pertanto, quando si lavora con EtBr sono essenziali adeguate precauzioni di sicurezza e tecniche di manipolazione adeguate.
In sintesi, l'EtBr svolge un ruolo fondamentale nell'elettroforesi legandosi agli acidi nucleici e consentendo la visualizzazione di frammenti di DNA o RNA sotto la luce UV. La sua elevata sensibilità e l'emissione di fluorescenza lo rendono un colorante ampiamente utilizzato per rilevare e analizzare campioni di acido nucleico nella ricerca genetica e di biologia molecolare.
