1. Double Membrane: I mitocondri possiedono una struttura a doppia membrana, con una membrana esterna e una membrana interna. Questo è diverso dalla maggior parte degli altri organelli, che hanno una singola membrana. La membrana interna viene piegata nelle cristae, aumentando la sua superficie per la produzione di ATP.

2. Replica semi-autonoma: I mitocondri hanno il proprio DNA (mtDNA) e ribosomi, consentendo loro di sintetizzare alcune delle loro proteine. Ciò consente loro di replicare indipendentemente dal nucleo della cellula, un processo noto come fissione binaria. Sebbene questa autonomia non sia assoluta (si basano ancora dal nucleo per alcune proteine), li distingue dagli organelli che dipendono interamente dal DNA nucleare della cellula.