Tuttavia, alcuni processi di fermentazione specializzati Può verificarsi in altri compartimenti cellulari:
* Mitocondri: Sebbene non direttamente coinvolti nella fermentazione, i mitocondri possono svolgere un ruolo in determinati percorsi di fermentazione fornendo substrati o rimuovendo sottoprodotti. Ad esempio, nella fermentazione dell'acido lattico, il piruvato prodotto nella glicolisi viene trasportato nei mitocondri, dove può essere ulteriormente elaborato.
* Vacuoli: In alcuni organismi, i vacuoli possono fungere da compartimenti di stoccaggio per i prodotti di fermentazione. Ad esempio, nel lievito, il vacuolo può immagazzinare etanolo prodotto durante la fermentazione alcolica.
È importante ricordare che queste sono eccezioni e la stragrande maggioranza dei processi di fermentazione si verifica nel citoplasma.