I ricercatori della North Carolina State University hanno creato un nuovo servizio online, ChemMaps, che consente agli utenti di navigare in modo interattivo nello spazio chimico di oltre 8, 000 farmaci e 47, 000 composti ambientali in 3-D e in tempo reale. ChemMaps è progettato per essere una risorsa centrale per studenti e ricercatori che desiderano visualizzare e studiare facilmente insiemi complicati di strutture chimiche.

La prima versione del sito Web gratuito è disponibile all'indirizzo http://www.chemmaps.com.

"La premessa per ChemMaps era di renderlo il Google Maps dei farmaci, "dice Denis Fourches, assistente professore di chimica presso la NC State. "Consente a chiunque utilizzi un computer o un tablet di navigare e navigare facilmente nello spazio chimico dei farmaci commercializzati in un ambiente 3D. Volevamo davvero rendere l'interfaccia grafica in ChemMaps rilevante per uno studente o per uno specialista in chimica farmaceutica. "

Con ChemMaps, le sostanze chimiche sembrano stelle, punti luminosi sparsi sullo schermo. ogni stella, o composto, è posizionato in relazione agli altri all'interno del complesso spazio chimico in base alle loro proprietà strutturali. Quando un utente fa clic su una particolare stella composta, vengono visualizzate diverse caratteristiche chiave di quella sostanza chimica:il suo nome sistematico, marchio, struttura chimica, indicazione medica, identificatori esterni, e altre proprietà chimico fisiche.

Attualmente, sono disponibili due mappe principali. La DrugMap comprende circa 8, 000 farmaci (commercializzati, in fase di sviluppo e ritirato) ed è stato preparato dal database DrugBank. La mappa ambientale, o EnvMap, comprende oltre 47, 000 composti (come pesticidi o ritardanti di fiamma) di rilevanza per il National Institute of Environmental Health Studies (NIEHS) e la United States Environmental Protection Agency (EPA) ed è stato preparato dal Tox21, Toxcast, e altri database NIEHS.

I ricercatori prevedono di aggiungere funzionalità nel tempo, inclusa la possibilità per i collaboratori e le aziende di visualizzare e proiettare insiemi proprietari di sostanze chimiche sulle ChemMaps. Hanno anche intenzione di rendere le mappe ancora più interattive, facile da manipolare, e compatibile con dispositivi di realtà aumentata e virtuale.

"Questo è il primo strumento di pubblico dominio che consente a chiunque, in particolare non esperti in chemininformatica, facilmente, accedere visivamente e rapidamente a tutte queste complesse informazioni sulla chimica in un unico posto, " Fourches dice. "Questo strumento potrebbe aiutare i ricercatori a capire meglio la vicinanza chimica di un particolare composto. Infatti, questo è fondamentale per il riutilizzo dei farmaci o la valutazione del rischio chimico".

La ricerca appare in Bioinformatica . Dott. Alex Borrel, ex borsista post-dottorato dello stato NC attualmente al NIEHS e primo autore del documento, creato il programma. Fourches ha ideato ChemMaps ed è l'autore corrispondente. Dott.ssa Nicole Kleinstreuer, biologo computazionale presso il NIEHS, anche contribuito al lavoro.