C'è una quantità sorprendente di informazioni memorizzate nella placca indurita, o calcolo, tra i denti. E se quel calcolo appartiene ai resti di una persona vissuta in tempi antichi, le informazioni potrebbero rivelare nuove intuizioni sul passato. Ma i piccoli campioni possono essere difficili da lavorare. Ora, nell'ACS' Journal of Proteome Research , gli scienziati applicano un nuovo metodo a questa analisi, trovare più proteine ​​rispetto agli approcci tradizionali.

La bocca umana è piena di molecole interessanti:DNA ed enzimi nella saliva, proteine ​​e lipidi da pezzetti di cibo incastrati tra i denti, i cittadini batterici del microbioma orale. Nelle giuste condizioni, quelle molecole possono essere conservate nel tartaro dentale per migliaia di anni. L'identificazione delle biomolecole conservate all'interno di antiche placche fornisce ai ricercatori indizi su come vivevano i nostri antenati, cosa mangiavano, quali malattie avevano e altro ancora. Però, c'è solo così tanta placca che si può raschiare via dai vecchi denti, quindi è importante applicare metodi in grado di estrarre la maggior parte delle informazioni da campioni minuscoli. Sebbene non esista un metodo gold standard per l'analisi del calcolo, sono spesso utilizzate tecniche basate su filtri, ma possono richiedere molto tempo e possono introdurre contaminanti. Così, le squadre guidate da Michael Buckley e Cheryl Makarewicz volevano vedere se un altro metodo, chiamato piatto unico, preparazione del campione in fase solida (SP3), potrebbe migliorare il numero e la complessità dei frammenti proteici che potrebbero essere analizzati dalla placca conservata.

I ricercatori, guidato da Karren Palmer, applicato SP3 all'analisi del calcolo da 153 individui antichi databili tra il 1 ^ns e 4 ^ns secolo a.C. Con SP3, perline magnetiche funzionalizzate afferrate su frammenti proteici, rendendoli facili da analizzare mediante spettrometria di massa. I ricercatori hanno scoperto che SP3 aumentava in modo affidabile il numero di frammenti proteici unici che potevano identificare nei campioni, compresi peptidi più piccoli che altri due metodi, ultrafiltrazione e precipitazione di acetone, perse. SP3 era anche facile da eseguire e aveva meno probabilità di introdurre contaminanti rispetto agli altri metodi. Utilizzando questo approccio, i ricercatori hanno identificato frammenti di proteine ​​del latte dalle diete dei soggetti, così come proteine ​​batteriche che potrebbero far luce su malattie antiche.