I legami idrogeno sono generalmente più forti dei legami coordinati. I legami idrogeno si formano tra un atomo di idrogeno e un atomo elettronegativo come azoto, ossigeno o fluoro. L'atomo elettronegativo attrae gli elettroni del legame idrogeno, creando una carica parziale positiva sull'atomo di idrogeno e una carica parziale negativa sull'atomo elettronegativo. Questa attrazione elettrostatica è ciò che tiene insieme il legame idrogeno.

I legami coordinati, noti anche come legami dativi, si formano quando un atomo dona una coppia di elettroni a un altro atomo. L'atomo che dona gli elettroni è chiamato base di Lewis, mentre l'atomo che accetta gli elettroni è chiamato acido di Lewis. I legami coordinati sono più deboli dei legami idrogeno perché l'attrazione elettrostatica tra i due atomi è più debole. Questo perché gli elettroni in un legame coordinato non sono condivisi equamente tra i due atomi, come lo sono in un legame idrogeno.

In generale, i legami idrogeno sono circa 10 volte più forti dei legami coordinati. Tuttavia, la forza di un legame idrogeno o di un legame coordinato può variare a seconda degli specifici atomi coinvolti.