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  • Uno sguardo nuovo all'interno delle nano-macchine proteiche

    Le caratteristiche nano-meccaniche essenziali delle proteine ​​possono essere convenientemente studiate con una geometria semplificata. Prendendo, Per esempio, un cilindro, e chiedendo «evolution» per trovare un canale fluido (mostrato in blu) una moltitudine di proprietà realistiche di proteine ​​reali appaiono naturalmente, ed esibire il vantaggio di concettuale, piuttosto che modelli dettagliati di proteine. Credito:© UNIGE - Jean-Pierre Eckmann

    Le proteine ​​digeriscono il cibo, e combattere infezioni e cancro, e svolgono altre funzioni metaboliche. Sono fondamentalmente nano-macchine, ognuno progettato per svolgere un compito specifico. Ma come si sono evolute per soddisfare tali esigenze, e in che modo i geni codificano la struttura e la funzione delle proteine? Ricercatori dell'Università di Ginevra (UNIGE), Svizzera, l'Istituto per le scienze di base, Corea, e la Rockefeller University, NOI., hanno condotto uno studio che affronta questa domanda e spiega la geometria di base del codice gene-proteina collegando le proteine ​​alle proprietà della materia fisica amorfa.

    L'articolo completo appare in Revisione fisica X .

    Una proteina è una catena composta da 20 diversi tipi di amminoacidi con interazioni elaborate, e a differenza della materia fisica standard, le proteine ​​sono selezionate dall'evoluzione. "Il progetto per la sintesi proteica è scritto in lunghi geni del DNA, ma mostriamo che solo una piccola frazione di questo enorme spazio informativo viene utilizzata per produrre la proteina funzionale, " spiega Jean-Pierre Eckmann, Professore presso il Dipartimento di Fisica Teorica della Facoltà di Scienze dell'UNIGE.

    Insieme al Prof. Tsvi Tlusty del Center for Soft and Living Matter, Institute for Basic Science (IBS) in Corea e il Prof. Albert Libchaber della Rockefeller University di New York, Il prof. Eckmann mostra che gli unici cambiamenti nel codice che contano sono quelli che si verificano nel segmento del gene che codifica le cerniere meccanicamente rilevanti della nanomacchina. Le modifiche in altre regioni di questo codice altamente ridondante non hanno alcun impatto. "Stiamo ora utilizzando questo nuovo approccio per comprendere la relazione tra la funzione e la dinamica di diverse proteine ​​importanti".


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