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I batteri producono un cocktail di vari prodotti naturali bioattivi per sopravvivere in ambienti ostili con (micro)organismi in competizione. Nel numero attuale di Natura chimica biologia , i ricercatori della Goethe University dimostrano di farlo modificando le strutture di base, simile all'approccio adottato nella ricerca farmaceutica.
Le fenazine sono prodotti naturali batterici diffusi e chimicamente diversi che possono svolgere varie funzioni biologiche. Come gli antibiotici, alcuni derivati uccidono i batteri; altri sono tossici per i funghi e/o le cellule cancerose. Esistono anche derivati che permettono ai batteri di sopravvivere in un ambiente a loro ostile, come il corpo umano. Questi fattori di virulenza sono spesso cruciali affinché i batteri diventino patogeni.
Biochimicamente, tutte le fenazine derivano da semplici strutture di base, come la fenazina-1, acido 6-dicarbossilico o acido fenazina-1-carbossilico, la cui biosintesi è ben nota. Però, queste strutture iniziali possono essere drasticamente modificate nella periferia in modo che sia possibile un gran numero di derivati della fenazina, molti dei quali possono effettivamente essere trovati in diversi batteri. Il gruppo di ricerca sulle biotecnologie molecolari guidato dal professor Helge Bode è ora riuscito a identificare nuovi meccanismi che consentono ai batteri di modificare queste semplici strutture di base, con conseguente derivati che agiscono su batteri sia Gram-positivi che Gram-negativi, così come su cellule di organismi superiori.
"I batteri sono in grado di determinare quali derivati dovrebbero essere creati utilizzando un nuovo intermedio aldeidico centrale e l'attivazione di un secondo cluster di geni biosintetici, " spiega il dottor Yi-Ming Shi, che ha studiato questo sistema durante una borsa di studio Humboldt. Ciò significa che i batteri utilizzano meccanismi per lo sviluppo di farmaci simili a quelli utilizzati nella ricerca farmaceutica, dove vengono prodotti nuovi derivati utilizzando le stesse strutture di base. Molto probabilmente i batteri usano le fenazine per uccidere altri batteri e funghi che sono concorrenti alimentari nel loro particolare ecosistema. Utilizzando una strategia di creazione di molti diversi tipi di derivati, i batteri sono ben attrezzati per contrastare concorrenti sconosciuti, poiché il cocktail di derivati mostra un'ampia gamma di attività biologica.
"Sarebbe ora affascinante scoprire come i batteri riconoscono effettivamente quali derivati sono necessari in un dato momento, " afferma Helge Bode. "O producono solo quei derivati che sono effettivamente necessari, o i batteri conservano un arsenale di derivati in modo che siano preparati per qualsiasi situazione."
Il gruppo proseguirà quindi le proprie ricerche in questo settore. I primi risultati sui meccanismi di regolazione sottostanti che potrebbero essere utilizzati anche per applicazioni biotecniche sembrano promettenti.