In un articolo pubblicato su Journal of Biological Chemistry , Il Dr. Özdemir ha studiato due famiglie di proteine ​​denominate Rho GTPases e IQGAP, che sono noti per svolgere un ruolo importante nelle metastasi del cancro. Queste due famiglie di proteine ​​"sospette" sono state studiate da molti ricercatori nel corso degli anni, ma l'interazione tra loro non era stata completamente compresa in precedenza.

È importante capire come le metastasi, la diffusione del cancro dal suo sito primario ad altri organi, ha luogo, perché prevenire le metastasi significa tenere sotto controllo il cancro. Questo è il motivo per cui il Dr. Özdemir ha scelto di studiare queste proteine, che sono noti per attivare le metastasi.

Richiedendo una grande quantità di calcolo probabilistico, lo studio è stato reso possibile solo attraverso tecniche di simulazione computazionale con l'ausilio di computer molto potenti. I ricercatori hanno costruito un ambiente di simulazione in cui molti elementi come la densità dell'acqua nella cellula, gli ioni e la struttura tridimensionale delle proteine ​​sono stati simulati in modo molto preciso. Ciò ha permesso di osservare come interagiscono esattamente le due proteine, i punti in cui si legano, e quali cambiamenti morfologici il legame ha causato nelle proteine.

La simulazione è durata sei mesi. Lo studio ha osservato i punti di legame e la sequenza delle due proteine, come la grande proteina ha trovato la sua corrispondenza, e come le due strutture complesse legate insieme. Ed è stato stabilito che le complesse strutture che si sono formate hanno attivato i meccanismi che hanno innescato le metastasi nelle cellule.

Lo studio della dott.ssa Sıla Özdemir è stato testato e replicato su cellule cancerose in un ambiente di laboratorio da un altro gruppo di ricerca presso il National Institutes of Health negli Stati Uniti (NIH), ei risultati hanno mostrato una corrispondenza esatta:l'esperimento ha verificato i dati prodotti attraverso le simulazioni al computer. Il risultato più importante di questa scoperta sarà il suo contributo alla progettazione di un farmaco mirato al meccanismo in questione.

Dopo la sua pubblicazione nel Journal of Biological Chemistry , tra le riviste più prestigiose del settore, La ricerca del Dr. Özdemir è stata pubblicata come parte di una raccolta speciale della rivista degli articoli più influenti del 2018.