1. Precipitazione degli acidi nucleici: L'acetato di sodio, quando aggiunto a una soluzione di DNA in condizioni controllate di temperatura e pH, aiuta nella precipitazione degli acidi nucleici (sia DNA che RNA) dalla soluzione. Riduce la solubilità del DNA neutralizzando le cariche negative presenti sullo scheletro fosfato della molecola di DNA. Ciò consente al DNA di formare sali insolubili, che possono essere facilmente separati dagli altri componenti del lisato cellulare.
2. Rimozione dei contaminanti: L'acetato di sodio aiuta nella rimozione di contaminanti, come proteine, detriti cellulari e altre impurità, durante l'isolamento del DNA. Quando si aggiunge acetato di sodio, questi contaminanti rimangono in soluzione, mentre il DNA precipitato può essere raccolto mediante centrifugazione.
3. Controllo del pH: L'acetato di sodio funge da tampone per mantenere il pH appropriato durante l'isolamento del DNA. Il pH ottimale per la precipitazione del DNA è solitamente compreso tra 5,0 e 5,2. L'acetato di sodio aiuta a mantenere questo intervallo di pH, che è fondamentale per un'efficiente precipitazione del DNA.
4. Elevata concentrazione di sale: L'elevata concentrazione di sale creata dall'acetato di sodio nella soluzione facilita la formazione di complessi DNA-proteina. Questi complessi sono essenziali per l'efficace separazione del DNA dagli altri componenti cellulari.
5. Ottimizzazione del recupero del DNA: L'acetato di sodio contribuisce all'ottimizzazione delle rese di recupero del DNA riducendo le interazioni non specifiche tra DNA e contaminanti. Un'adeguata concentrazione di sale aiuta a garantire che il DNA venga precipitato selettivamente, riducendo al minimo la perdita di DNA durante il processo di isolamento.
6. Compatibilità con i passaggi successivi: L'acetato di sodio è compatibile con le fasi successive dell'isolamento e della purificazione del DNA. Il DNA precipitato può essere facilmente lavato, ridisciolto in tamponi appropriati e ulteriormente processato per applicazioni a valle come PCR, reazioni enzimatiche o sequenziamento.
Nel complesso, l'acetato di sodio svolge un ruolo vitale nella precipitazione del DNA dai lisati cellulari durante l'isolamento del DNA. Contribuisce all'efficace separazione del DNA dalle impurità, mantenendo condizioni di pH ottimali e facilitando il trattamento a valle del DNA isolato.
