In natura, il clorato di potassio svolge un ruolo nel ciclo del cloro nell'ambiente. È uno degli intermedi formati durante l'ossidazione degli ioni cloruro nell'acqua di mare e in altri corpi idrici naturali. Il processo di ossidazione è spesso guidato dall’azione di microrganismi, come alcuni batteri e alghe, che utilizzano il cloruro come donatore di elettroni durante la fotosintesi.
Il clorato di potassio si trova anche in alcune piante, dove può accumularsi a seguito dei processi metabolici della pianta o come risultato dell'assorbimento di clorato dall'ambiente. Tuttavia, le concentrazioni di clorato di potassio nelle piante sono generalmente molto basse e non rappresentano un rischio significativo per la salute umana o per l’ambiente.
Nel complesso, il clorato di potassio è una sostanza naturale che si trova nei depositi minerali e come risultato dell'attività microbica nell'ambiente. La sua presenza e distribuzione sono influenzate da fattori geologici e biologici e le sue concentrazioni sono generalmente basse negli ecosistemi naturali.
