Gli amminoacidi contengono anche un gruppo amminico (-NH2), che è un gruppo basico. Il gruppo amminico può accettare uno ione idrogeno (H+), che conferisce all'amminoacido una carica netta positiva. Questa carica positiva è ciò che conferisce agli amminoacidi le loro proprietà di base.
L'equilibrio tra i gruppi acidi e basici negli amminoacidi determina la loro carica complessiva. A pH neutro, la maggior parte degli amminoacidi hanno una carica netta negativa perché il gruppo carbossilico è più acido del gruppo amminico. Tuttavia, alcuni amminoacidi, come la lisina e l'arginina, hanno più gruppi basici che gruppi acidi e quindi hanno una carica netta positiva a pH neutro.
