Le pompe ioniche utilizzano l'ATP per trasportare gli ioni idrogeno attraverso una membrana, creando un gradiente protonico che guida i processi cellulari. Queste pompe contengono un canale proteico che facilita il movimento degli ioni idrogeno. Il canale è formato da diversi residui amminoacidici che rivestono l'interno della proteina e creano un ambiente idrofilo per il passaggio degli ioni idrogeno. Questi residui hanno gruppi funzionali che possono interagire con gli ioni idrogeno, consentendo loro di essere trasportati attraverso la membrana. La struttura del canale garantisce il trasporto specifico ed efficiente degli ioni idrogeno, consentendo alla pompa di mantenere il gradiente protonico e supportare le funzioni cellulari.