* Forza di legame: I legami peptidici nelle proteine sono relativamente forti e richiedono energia significativa per rompere. Al contrario, i legami di fosfodiester negli acidi nucleici sono più deboli e più sensibili all'idrolisi.
* Struttura: Le proteine hanno una struttura tridimensionale più compatta e stabile, che protegge i legami peptidici dagli attacchi dell'acido. Gli acidi nucleici, d'altra parte, hanno una struttura più aperta e flessibile, rendendo i loro legami fosfodiester più accessibili all'idrolisi.
* Sensibilità al pH: Le proteine possono tollerare una gamma più ampia di valori di pH rispetto agli acidi nucleici. Mentre entrambe le molecole sono sensibili alle condizioni di pH estreme, gli acidi nucleici sono particolarmente vulnerabili alla degradazione a basso pH (condizioni acide). Questo perché l'ambiente acido può protonare i gruppi di fosfato negli acidi nucleici, rendendoli più suscettibili all'idrolisi.
In sintesi: Le proteine sono più resistenti all'idrolisi acida rispetto agli acidi nucleici a causa dei legami peptidici più forti, della struttura più stabile e della maggiore tolleranza per gli ambienti acidi.