Il deserto del Mojave è sede di numerose comunità del deserto in rapida crescita ed è accessibile alle grandi popolazioni che si affacciano sul deserto. L'inquinamento da attività urbane, agricole e minerarie ha un forte impatto sui delicati ecosistemi desertici del Mojave e mette a rischio anche la salute umana. Inoltre, un gran numero di persone usa il Mojave per la ricreazione, causando ulteriore degrado.
Inquinamento idrico
L'acqua è una risorsa scarsa nel Mojave. Quasi tutta l'acqua per uso residenziale, industriale e agricolo proviene dalle falde acquifere. Le risorse idriche sono già sovra-allocate. Sulla base delle proiezioni sulla crescita della popolazione, si prevede che la domanda supererà l'offerta nel corso della nostra vita. L'estrazione dell'acqua drena zone umide e fiumi, distruggendo l'habitat di molte specie di pesci e di animali selvatici, alcuni dei quali sono unici al Mojave. Alcune acque vengono restituite alle falde acquifere e alle acque superficiali, ma poiché questa acqua defluisce dalle aree urbane, agricole e minerarie, è spesso contaminata da sostanze chimiche, metalli e sostanze nutritive.
Piante invasive
Arricchimento dell'azoto del suolo, causato dalla caduta a secco di sostanze inquinanti dall'aria, insieme al disturbo del suolo hanno trasformato il Mojave in un rifugio per le piante invasive. Lo spostamento delle specie di piante autoctone da parte di specie invasive ha molti effetti negativi sull'ecosistema del Mojave. Le piante invasive potrebbero non essere adatte alla fauna selvatica nativa, che spesso dipende dalla vegetazione nativa per cibo o riparo. Inoltre, con l'aumento della diversità delle piante introdotte arriva il potenziale per l'invasione di animali introdotti. Alcune specie di piante invasive comuni sono saltcedar, brome grass, alghe perenni e cardo russo. Queste specie crescono su aree molto più grandi rispetto alle piante native, fornendo ulteriore combustibile per gli incendi che sono diventati più frequenti e intensi. Questo è un grosso problema per gli ecosistemi di Mojave, che non sono abituati a bruciare frequentemente.
Inquinamento atmosferico
Ci sono due principali fonti di inquinamento atmosferico nel Mojave. Il primo è lo smog, che viene trasportato nel deserto dalle città confinanti. Lo smog contiene alte concentrazioni di monossido di carbonio e biossido di azoto, nonché ozono, particolato e metalli. Questi contaminanti dell'aria causano scarsa visibilità, problemi di salute umana e danni a piante e animali. La seconda fonte è il disturbo del suolo del deserto causato da attività come ricreazione fuoristrada, agricoltura, costruzione di infrastrutture, esercitazioni militari e operazioni minerarie. Queste attività generano polvere, che può aggregarsi in grandi pennacchi. Ciò si è rivelato particolarmente dannoso per la vegetazione desertica. In un articolo pubblicato nel numero di agosto 1997 del "Journal of Applied Ecology", i ricercatori hanno scoperto che la polvere trasportata dal vento riduceva i tassi di fotosintesi di tre specie di piante del Mojave nativo impedendo lo scambio di gas e la traspirazione e causando una riduzione dell'efficienza nell'uso dell'acqua. >
Inquinamento da lettiera
Il deserto del Mojave è l'habitat critico per la tartaruga del deserto, che ora è elencata come minacciata dal Servizio Fish and Wildlife degli Stati Uniti. Il declino della tartaruga del deserto può essere attribuito interamente ai cambiamenti dell'habitat umano-indotti. Un articolo pubblicato nel numero di gennaio 2007 del "naturalista nordamericano occidentale" riporta gli effetti della lettiera sulle tartarughe del deserto nel deserto del Mojave. Gli autori notano che la morte o l'infortunio delle tartarughe catturate nei rifiuti, o che consumano rifiuti, non è nuovo. Dopo aver visto una tartaruga mangiare un palloncino, hanno notato che 178 nuovi palloncini hanno soffiato nel loro sito di studio Mojave per un periodo di nove mesi. Molti altri tipi di animali selvatici sono anche influenzati negativamente dalla spazzatura scartata.
