Allo scopo di contribuire a un sistema di monitoraggio o di allerta precoce per la diffusione della pandemia in una determinata regione, Secondo quanto riferito, un team di ricerca svedese ha ottimizzato un metodo per concentrare le particelle di SARS-CoV-2 nei sistemi fognari municipali.

Dopo aver confrontato con altre tecniche standard, i ricercatori hanno concluso che il metodo ottimizzato, che è stato sviluppato al KTH Royal Institute of Technology, affronta due sfide nella misurazione dei livelli di coronavirus nelle acque reflue:che si riscontrano differenze sostanziali nelle acque reflue raccolte in varie parti del mondo, e che le particelle virali diventano altamente diluite nelle acque reflue.

I ricercatori hanno anche riferito che nell'applicare la metodologia, le loro misurazioni del coronavirus nelle acque reflue di Stoccolma negli ultimi cinque mesi sono state coerenti con i dati sulle infezioni raccolti dalle autorità sanitarie pubbliche attraverso test individuali.

L'epidemiologia basata sulle acque reflue può essere un'alternativa conveniente per testare grandi popolazioni per il virus SARS-CoV-2, e ha il potenziale per essere utilizzato come sistema di allerta precoce per la diffusione della pandemia, dice Hakim Jafferali, un ricercatore con Science for Life Laboratory presso KTH (SciLifeLab). "Così, un sistema di rilevamento affidabile richiede un metodo convalidato - e un virus di riferimento adatto - affinché il virus SARS-CoV-2 concentrato sia pronto per ulteriori elaborazioni e analisi, " lui dice.

La tecnica pubblicata in Scienza dell'ambiente totale è una modifica di un metodo di ultrafiltrazione esistente. Sono stati confrontati diversi metodi standard per concentrare il virus nelle acque reflue, utilizzando campioni di acque reflue provenienti dalla Svezia e dal Nord Italia. Ai fini della valutazione, i ricercatori hanno aggiunto un coronavirus bovino simile allo stesso genere di SARS-CoV-2, come riferimento esterno. Virus della screziatura del peperone (PMMV), che è un indicatore di contaminazione fecale nei sistemi di acque reflue, è risultato essere un virus di riferimento interno affidabile.

Jafferali afferma che una tecnica basata sull'ultrafiltrazione si è costantemente dimostrata più sensibile con cambiamenti come il raddoppiamento del numero di volte in cui i campioni vengono centrifugati. Il metodo è abbinato alla tecnica di laboratorio del real-time, reazione a catena della polimerasi qualitativa (qPCR), che monitora l'amplificazione di una molecola di DNA mirata durante la PCR, non alla fine, come nella PCR convenzionale. La ricerca è stata eseguita presso KTH e SciLifeLab.