* Eredità genetica: Darwin non capiva il meccanismo dell'eredità. Sapeva che i tratti erano tramandati dai genitori alla prole, ma non sapeva come. Questo è stato successivamente spiegato dal lavoro di Gregor Mendel sulla genetica.
* DNA come portatore di informazioni genetiche: Darwin non era a conoscenza dell'esistenza del DNA. La scoperta del DNA come molecola responsabile del trasporto di informazioni genetiche è arrivata molto più tardi.
* Mutazioni come fonte di variazione: Darwin ha riconosciuto che esistevano variazioni all'interno delle popolazioni, ma non capiva come si presentassero quelle variazioni. Le mutazioni, che sono cambiamenti nella sequenza del DNA, sono ora intese come la fonte primaria di nuove varianti.
* Equilibrio punteggiato: Questa teoria, proposta da Stephen Jay Gould e Niles Eldredge, suggerisce che l'evoluzione avviene in esplosioni di rapidi cambiamenti intervallati da lunghi periodi di stabilità. La teoria di Darwin, d'altra parte, ha sottolineato il cambiamento graduale nel tempo.
È importante ricordare che la teoria di Darwin si basava sulle conoscenze disponibili ai suoi tempi. Man mano che la scienza è progredita, la nostra comprensione dell'evoluzione è diventata più sofisticata, incorporando nuovi principi e espandendosi sulle idee originali di Darwin.
