I collaboratori della Mayo-Illinois Alliance for Technology Based Healthcare hanno sviluppato un nuovo, test a singola molecola per la rilevazione del DNA metilato. La metilazione, l'aggiunta di un gruppo metilico di molecole a un filamento di DNA, è uno dei modi in cui viene regolata l'espressione genica. I risultati appaiono nell'attuale numero di Rapporti scientifici .

"Mentre i nanopori sono stati studiati per il sequenziamento genomico e l'analisi di screening, questo nuovo test può potenzialmente eludere la necessità di alcuni degli attuali processi nella valutazione delle malattie legate all'epigenetica, "dice Giorgio Vasmatzis, dottorato di ricerca, co-leader del programma di scoperta dei biomarcatori di Mayo presso il Center for Individualized Medicine e co-autore dell'articolo. Dice che il test potrebbe eliminare la necessità della conversione del DNA con bisolfito, etichettatura fluorescente, e reazione a catena della polimerasi (PCR).

"I prossimi passi includono l'aumento della risoluzione spaziale incorporando membrane più sottili e integrando le stesse fasi di preparazione, "dice Rashid Bashir, dottorato di ricerca, professore di bioingegneria, direttore del Laboratorio di Micro e Nanotecnologie, e co-autore principale dello studio presso l'Università dell'Illinois a Urbana-Champaign.

Un nanoporo, in questo caso, è un foro molto piccolo in una membrana artificiale, che consente di localizzare e identificare solo una singola molecola. I ricercatori affermano che questo è utile poiché la metilazione nelle sequenze del promotore può indicare lo sviluppo del tumore nella maggior parte dei principali tipi di cancro e può essere un biomarcatore migliore di molti marcatori genetici. Gli scienziati sono ora in grado di differenziare il DNA metilato da quello non metilato attaccando una proteina sui nucleotidi metilati che misurano la corrente elettrica ionica tramite un nanoporo allo stato solido.