Una delle sfide con il sequenziamento del DNA con nanopori è che i pori sono molto piccoli e può essere difficile far passare le molecole di DNA attraverso di essi. Ciò può portare a errori nei dati di sequenziamento.
Un team di ricercatori dell’Università della California, San Diego, ha sviluppato un nuovo metodo di simulazione che può aiutare a superare questa sfida. Le simulazioni mostrano che le molecole di DNA possono passare più facilmente attraverso i pori se sono rivestite con uno strato di molecole d'acqua.
I ricercatori ritengono che questa nuova scoperta potrebbe portare a miglioramenti nella tecnologia di sequenziamento del DNA tramite nanopori, rendendola più accurata e affidabile.
Il sequenziamento del DNA con nanopori funziona facendo passare una molecola di DNA attraverso un minuscolo poro in una membrana. Il poro è così piccolo che solo le molecole di DNA a filamento singolo possono attraversarlo. Quando la molecola di DNA passa attraverso il poro, interrompe la corrente elettrica che scorre attraverso la membrana. Questa interruzione viene rilevata da un sensore e la sequenza della molecola di DNA può essere determinata analizzando lo schema delle interruzioni.
Una delle sfide con il sequenziamento del DNA con nanopori è che i pori sono molto piccoli e può essere difficile far passare le molecole di DNA attraverso di essi. Ciò può portare a errori nei dati di sequenziamento. Un’altra sfida è che le molecole di DNA possono essere danneggiate mentre attraversano il poro, il che può anche portare a errori.
Il nuovo metodo di simulazione sviluppato dai ricercatori dell'Università della California, San Diego, mostra che le molecole di DNA possono passare più facilmente attraverso i pori se sono rivestite con uno strato di molecole d'acqua. Questo perché le molecole d'acqua aiutano a lubrificare la molecola di DNA e a ridurre l'attrito tra la molecola di DNA e il poro.
I ricercatori ritengono che questa nuova scoperta potrebbe portare a miglioramenti nella tecnologia di sequenziamento del DNA tramite nanopori, rendendola più accurata e affidabile.
Il sequenziamento del DNA con nanopori ha una serie di potenziali applicazioni, tra cui:
*Sequenziamento rapido del DNA di agenti patogeni, che potrebbe aiutare a diagnosticare le malattie più rapidamente.
*Sequenziamento del DNA di singole cellule, che potrebbe aiutare a identificare le mutazioni genetiche associate alle malattie.
*Sequenziamento del DNA antico, che potrebbe aiutare a far luce sulla storia dell'evoluzione umana.
Il sequenziamento del DNA con nanopori è ancora in fase di sviluppo, ma ha il potenziale per rivoluzionare il campo del sequenziamento del DNA.
