Il complesso centrale è costituito da diverse regioni interconnesse, tra cui il protocerebrum, il corpo ellissoidale e il corpo a forma di ventaglio. Ciascuna di queste regioni riceve input sensoriali da diverse modalità e contribuisce alla rappresentazione complessiva della posizione e del movimento della mosca.
Il protocerebrum contiene neuroni che elaborano le informazioni visive. Questi neuroni ricevono input dagli occhi composti della mosca e calcolano la direzione e la velocità del movimento della scena visiva. Il corpo ellissoidale, d'altra parte, integra segnali vestibolari provenienti dalle antenne e dalle cavezze della mosca (piccole strutture a forma di mazza vicino alle ali). Questi segnali forniscono informazioni sui movimenti della testa e sulle rotazioni del corpo della mosca.
Il corpo a forma di ventaglio riceve input dai neuroni propriocettivi situati nelle zampe e nelle ali della mosca. Questi neuroni forniscono informazioni sulla posizione e sul movimento delle appendici della mosca. Integrando le informazioni provenienti da questi diversi input sensoriali, il complesso centrale genera una rappresentazione completa della posizione della mosca nello spazio.
Il complesso centrale invia segnali ad altre regioni del cervello, compresi i centri di controllo motorio, che utilizzano queste informazioni per coordinare i movimenti della mosca e mantenerne la stabilità durante il volo e altri comportamenti.
Lo studio del complesso centrale della mosca ha fornito preziose informazioni sui meccanismi neurali alla base della navigazione spaziale e del controllo del movimento. Questa ricerca ha anche contribuito allo sviluppo di sistemi di navigazione e controllo bio-ispirati per veicoli autonomi e altre applicazioni di robotica.