È importante notare che:
* L'inventore esatto è incerto. Alcuni storici credono che suo padre, Hans Janssen, potrebbe essere stato coinvolto e ci sono affermazioni che Cornelis Drebbel, un altro inventore olandese, ha sviluppato anche un dispositivo simile nello stesso periodo.
* Questi primi microscopi erano molto semplici. Consistevano in due obiettivi in un tubo e fornivano un ingrandimento limitato.
Nonostante l'incertezza, Zacharias Janssen è la figura più comunemente riconosciuta associata all'invenzione del primo microscopio primitivo.