La struttura del DNA a doppio filamento è universale in tutte le cellule viventi, ma si verificano differenze nei metodi per estrarre il DNA genomico da cellule animali e vegetali. Sebbene il DNA genomico risieda nel nucleo delle cellule, la quantità e la purezza del DNA estratto dipende dal tipo e dalle dimensioni della cellula. Ad esempio, alcune cellule contengono più DNA e impurità rispetto ad altre. Continua a leggere per saperne di più sulle differenze di estrazione del DNA.
Estrazione generale del DNA
Se tratti le cellule vegetali e animali con una sostanza insaponata, degraderanno i lipidi nelle cellule e nelle membrane nucleari. Quindi, la miscela di DNA si separerà dalle membrane cellulari e dalle proteine. Successivamente, puoi usare l'alcol per precipitare il DNA nella soluzione. A seconda della quantità nel campione, il DNA può essere visibile ad occhio nudo. Tuttavia, tieni presente che questa semplice procedura non produce necessariamente DNA di elevata purezza.
Cellule vegetali e animali
Le cellule vegetali differiscono dalle cellule animali a causa della loro rigida parete cellulare e organelli come il cloroplasto. Contengono anche proteine ed enzimi che svolgono un ruolo nella fotosintesi. Alcune cellule vegetali hanno poliploidia, nel senso che hanno più di una copia di ciascun cromosoma per cellula. Inoltre, i processi cellulari che si verificano in piante come la fotosintesi producono una gamma di metaboliti secondari. Le cellule animali non hanno una parete cellulare, ma hanno ancora bisogno di sostanze chimiche come il dodecilsolfato di sodio (SDS) per interrompere la membrana cellulare e rilasciare il DNA genomico.
Estrazione del DNA vegetale
Il DNA genomico vegetale è più difficile da estrarre a causa della parete cellulare della pianta. È possibile rimuoverlo per omogeneizzazione o aggiungendo cellulasi per degradare la cellulosa che costituisce la parete cellulare. Inoltre, i metaboliti presenti nella cellula vegetale possono interferire con l'estrazione del DNA genomico contaminando il campione di DNA durante il processo di precipitazione.
Estrazione del DNA animale
I leucociti del sangue periferico sono la principale fonte di DNA genomico animale, ma la raccolta dei campioni è difficile perché il sangue deve provenire direttamente dall'animale. Il sangue contiene una gamma di composti come proteine, lipidi, globuli bianchi, globuli rossi, piastrine e plasma, che possono contaminare il campione di DNA. Tuttavia, il principale contaminante del DNA animale estratto dai campioni di sangue è l'eme, che è il componente non proteico dell'emoglobina.
Le differenze del DNA
Le differenze tra DNA vegetale e animale si trovano nella sequenza delle basi nell'elica. I composti trovati nelle cellule vegetali sono assenti nelle cellule animali e le sequenze di basi del DNA lo riflettono. Inoltre, il DNA della pianta genomica è spesso più grande del DNA animale. Queste differenze influiscono anche sui metodi di estrazione, sulla resa e sulla purezza del DNA.
