Gli archaebacteria sono organismi che sono in realtà biochimicamente e geneticamente molto diversi dagli altri batteri. Quindi, archaebacteria è un termine obsoleto e ora sono classificati nel dominio Archaea. Le classificazioni all'interno di questo dominio non sono ufficiali a causa dei dibattiti sulla discendenza dei microbi. Molti vivono nelle temperature estreme delle aperture idrotermali in profondità nell'oceano o nelle sorgenti calde e alcuni vivono nel fango privo di ossigeno. Altri vivono in acqua molto salata e altri ancora in ambienti estremamente alcalini o acidi, o addirittura in olio. I seguenti esempi sono classificati in base all'ordine tassonomico di regno, phylum, classe, ordine, famiglia, genere e specie.
Archaea di sfiato idrotermale

Un esempio nel dominio dell'Archaea è Methanocaldococcus jannaschii
, attualmente classificato come Archaea: Euryarchaeota: Methanobacteria; Methanobacteriales: Methanobacteriaceae, Methanocaldococcus e specie jannaschii. È stato ottenuto da uno sfogo idrotermale sul fondo dell'oceano che vive a pressioni di oltre 200 atmosfere e temperature superiori a 85 gradi Celsius. Sopravvive senza ossigeno e produce metano come prodotto del suo metabolismo.
Archaea Fiorente nell'intestino umano

Methanibrevibacter smithii
attualmente classificato come Archaea; ", 0]

,metanobatteri; methanobacteria; Methanobacteriaceae; Methanobrevibacter e specie smithii. Occupa l'intestino umano e funziona senza ossigeno. Converte CO _{2 in metano ed è importante nella scomposizione dei nutrienti.
Salt Loving Archaea}

Haloquadra walsbyi
è attualmente classificato Archaea; ", 0]

,halobacteria; Halobacteriales; Halobacteriaceae; ", 0]

,e specie walsbyi. Risiede in ambienti estremamente salati e utilizza l'energia del sole nel processo fotosintetico. Sono di forma quadrata e hanno sacche piene di gas che consentono loro di galleggiare. Possono anche collegarsi e formare grandi fogli.
Archaea di acque profonde che usano zolfo

Thermococcus litoralis
è un'altra specie di sfogo termico di acque profonde. Attualmente è classificato come Archaea; ", 0]

,Thermococci; Thermococcacae; Thermococcus; e specie litoralis. Richiede zolfo per crescere e, a differenza degli altri esempi, non produce metano. Prospera alle alte temperature ed è uno degli archaea, comprese le specie ancora da scoprire.
Piccoli archaea parassiti si trovano da soli nella classificazione

Nanoarchaeum equitans
è l'unico membro noto della sottoclasse Nanoarchaeota di Archaea. Gli scienziati hanno scoperto che viveva sulle pareti cellulari di una nuova specie di Ignicoccus trovata sul fondo dell'oceano, vicino alle prese d'aria termali e in una sorgente termale situata nel Parco Nazionale di Yellowstone. Nanoarchaeum equitans
, che sembra avere una relazione parassitaria con la specie Ignicoccus
, è piccolo, ha solo 400 nanometri di diametro e sembra prosperare a temperature comprese tra 167 e 204 gradi Fahrenheit.