Le origini del Dimorphos non sono state ancora stabilite in modo definitivo dagli scienziati. Una teoria suggerisce che Dimorphos e Didymos una volta erano un unico oggetto cosmico che in passato ha subito una collisione energetica, causando la rottura del sistema proto-Didymos in due corpi distinti. Un'altra teoria propone che gli asteroidi non siano mai stati un singolo oggetto, ma si siano formati indipendentemente all'interno dello stesso quartiere celeste e si siano evoluti per essere legati gravitazionalmente nel tempo.