I ricercatori hanno generato un assemblaggio del genoma di alta qualità di un asino maschio utilizzando una combinazione di tecnologie di sequenziamento a lettura lunga e sequenziamento a lettura breve. Confrontando il genoma dell'asino con quello dei cavalli e delle zebre, il team ha identificato differenze genomiche chiave che potrebbero aver contribuito ai tratti unici e agli adattamenti di queste specie.
Asini e cavalli, che appartengono allo stesso genere Equus, si sono differenziati da un antenato comune circa 4,5 milioni di anni fa. I ricercatori hanno scoperto che il genoma dell’asino ha subito sostanziali riarrangiamenti cromosomici ed espansioni della famiglia genetica rispetto al genoma del cavallo. Questi cambiamenti genomici potrebbero aver avuto un ruolo nella divergenza degli asini e dei cavalli e nel loro adattamento ad ambienti diversi.
Ad esempio, il genoma dell’asino ha mostrato un’espansione delle famiglie di geni coinvolti nella risposta immunitaria e nella digestione, che potrebbero aver contribuito alla capacità dell’asino di sopravvivere in ambienti difficili e con risorse limitate. Lo studio ha anche rivelato che il genoma dell’asino contiene una percentuale maggiore di elementi ripetitivi, compresi gli elementi trasponibili, rispetto al genoma del cavallo. Questi elementi ripetitivi potrebbero aver avuto un ruolo nell'evoluzione e nell'adattamento del genoma.
I ricercatori hanno anche identificato diverse regioni genomiche che potrebbero essere associate a tratti specifici negli asini, come le dimensioni corporee più piccole e la capacità di trasportare carichi pesanti. Queste regioni contengono geni coinvolti nello sviluppo scheletrico, nella funzione muscolare e nel metabolismo. Sono necessari ulteriori studi per indagare i ruoli funzionali di questi geni e il loro contributo alle caratteristiche uniche degli asini.
L’assemblaggio del genoma dell’asino di alta qualità fornisce una risorsa preziosa per la ricerca futura sull’evoluzione, la genetica e la biologia di questa specie. Ha anche potenziali implicazioni per la comprensione delle basi genetiche di tratti importanti negli asini, che potrebbero essere utili per l’allevamento selettivo e gli sforzi di conservazione.