1. Sequenziamento del genoma virale:
- Gli scienziati sequenziano l'intero genoma virale dei campioni COVID-19 raccolti dai pazienti.
- Le tecnologie di sequenziamento ad alto rendimento, come il sequenziamento di nuova generazione (NGS), vengono utilizzate per determinare la sequenza genetica del virus.
- Ciò fornisce una comprensione completa del genoma virale e identifica mutazioni, inserzioni o delezioni specifiche che potrebbero essersi verificate.
2. Analisi filogenetica:
- L'analisi filogenetica prevede la costruzione di alberi evolutivi basati su sequenze di genomi virali.
- Confrontando le sequenze genetiche di diversi campioni di COVID-19, gli scienziati possono determinare la parentela e la storia evolutiva del virus.
- Ciò aiuta a tracciare le origini geografiche e le vie di trasmissione del virus.
3. Identificazione della variante:
- Man mano che il virus COVID-19 si evolve, emergono nuove varianti genetiche.
- Gli scienziati monitorano continuamente queste varianti confrontando le sequenze del genoma virale con la sequenza di riferimento del SARS-CoV-2 originale.
- Le varianti con cambiamenti significativi o potenziale impatto sul comportamento del virus, sulla trasmissibilità o sulla risposta immunitaria sono designate come "varianti preoccupanti" (VOC) o "varianti di interesse" (VOI) per ulteriori indagini.
4. Monitoraggio delle mutazioni:
- Attraverso la sorveglianza genomica, i ricercatori monitorano nel tempo mutazioni specifiche nel genoma virale.
- Le mutazioni in alcune regioni del genoma virale, come la proteina spike, possono influenzare la capacità del virus di legarsi alle cellule ospiti ed eludere le risposte immunitarie.
- Il monitoraggio delle mutazioni aiuta a comprendere le potenziali implicazioni sull'efficacia del vaccino, sui test diagnostici e sulle strategie di trattamento.
5. Epidemiologia genomica:
- L'epidemiologia genomica combina il sequenziamento del genoma virale con i dati epidemiologici.
- Analizzando la diversità genetica e la distribuzione dei ceppi di COVID-19 in diverse regioni geografiche, gli scienziati possono identificare i fattori che influenzano la trasmissione e la diffusione del virus.
- Queste informazioni supportano gli interventi di sanità pubblica e le strategie di contenimento.
6. Monitoraggio in tempo reale:
- Alcuni gruppi di ricerca e agenzie di sanità pubblica hanno istituito sistemi di sorveglianza che forniscono un monitoraggio in tempo reale dell’evoluzione genetica del COVID-19.
- Questi sistemi raccolgono e analizzano continuamente le sequenze del genoma virale per tracciare le varianti emergenti e informare le politiche di sanità pubblica e il processo decisionale.
Utilizzando questi metodi di tracciamento genetico, gli scienziati mirano a monitorare l’evoluzione di COVID-19, identificare i potenziali rischi associati a nuove varianti e contribuire agli sforzi in corso per combattere efficacemente la pandemia.
