Il microscopio viene utilizzato in una varietà di campi scientifici per molti scopi diversi. Che si tratti di medicina legale o di medicina tradizionale, il microscopio è uno strumento indispensabile.
Analisi dei tessuti

È comune per gli istologi studiare cellule e tessuti usando il microscopio. Ad esempio, se una sezione di tessuto viene presa per analisi, gli istologi possono utilizzare un microscopio in combinazione con altri strumenti per determinare se il campione è canceroso.
Esame delle prove forensi

Le prove raccolte in una scena del crimine possono contiene informazioni che non sono visibili ad occhio nudo. Ad esempio, le striature dei proiettili possono essere esaminate al microscopio per vedere se corrispondono ai proiettili sparati da una pistola particolare.
Determinare la salute di un ecosistema

È comune per i biologi sul campo monitorare la salute di un particolare ecosistema, come un ruscello, utilizzando i microscopi per identificare il numero e la diversità degli organismi in una determinata regione nel tempo.
Studiare il ruolo di una proteina all'interno di una cellula

I ricercatori hanno scoperto che i microscopi un strumento inestimabile quando studiano la funzione delle proteine all'interno delle cellule. Con la tecnologia di oggi, molte proteine possono essere etichettate con un tag e studiate in cellule vive.
Studio delle strutture atomiche

Microscopi potenti come i microscopi a forza atomica hanno aiutato gli scienziati a studiare le superfici dei singoli atomi.