1. Un nucleo: I protisti sono eucarioti, il che significa che hanno un vero nucleo che racchiude il loro DNA. I batteri sono procarioti e il loro DNA si trova in una regione chiamata nucleoide, che non è racchiusa da una membrana.
2. Organelli: I protisti hanno vari organelli legati alla membrana, come i mitocondri, l'apparato del Golgi e il reticolo endoplasmatico. Questi organelli sono responsabili dello svolgimento di funzioni specifiche all'interno della cella. I batteri mancano di questi organelli complessi.
Mentre ci sono alcune eccezioni (ad esempio, alcuni batteri hanno strutture legate alla membrana che assomigliano agli organelli), in generale, la presenza di un nucleo e altri organelli legati alla membrana stanno definendo le caratteristiche che distinguono i protisti dai batteri.
