1. Emasculation: Ha rimosso con cura le antere (le parti riproduttive maschili) dai fiori delle piante che voleva usare come genitore femminile. Ciò ha impedito al fiore di auto-impollinazione.
2. Pollinazione incrociata: Mendel prese quindi il polline dalle antere di una pianta diversa (il genitore maschio) e lo trasferì manualmente nello stigma (la parte femminile) del fiore emascolato.
3. Ambiente controllato: Ha condotto questi esperimenti in un ambiente controllato per evitare l'impollinazione accidentale da parte di insetti o vento.
Con questi passaggi, Mendel potrebbe essere sicuro che la progenie che ha osservato derivasse solo dalla specifica impollinazione incrociata che intendeva. Ciò gli ha permesso di tenere traccia dell'eredità dei tratti attraverso le generazioni e di stabilire le sue leggi fondamentali dell'eredità.