1. Record fossile: I fossili forniscono un record diretto della vita sulla Terra per milioni di anni. Vediamo chiari schemi di cambiamento negli organismi nel tempo, con forme di vita più semplici che appaiono in precedenza nella documentazione geologica e forme più complesse che emergono in seguito. Ad esempio, il record fossile mostra il passaggio dai pesci agli anfibi, nei rettili ai mammiferi e l'evoluzione dei cavalli da piccoli antenati multi-dita ai grandi animali single-dita che conosciamo oggi. Questa progressione di fossili fornisce prove convincenti che la vita è cambiata nel tempo, supportando l'idea dell'evoluzione.
2. Strutture omologhe: Queste sono strutture trovate in diverse specie che condividono un'anatomia sottostante comune, nonostante abbiano funzioni diverse. Un esempio classico è la struttura ossea negli arti anteriori dei vertebrati:umani, gatti, pipistrelli e balene condividono tutti una disposizione ossea simile nei loro anteprimi, anche se questi arti sono usati per attività molto diverse (afferrare, camminare, volare, nuotare). Questa somiglianza indica un antenato comune, indicando che queste specie discendevano da un lignaggio condiviso. La presenza di strutture omologhe supporta fortemente l'idea di una discesa comune e del cambiamento evolutivo.