Nel 1665, usò un microscopio composto per esaminare una sottile fetta di sughero. Ha osservato piccoli compartimenti a forma di scatola che ha chiamato "cellule" perché gli hanno ricordato le cellule in un monastero.
Mentre Hooke non ha visto le cellule viventi, le sue osservazioni hanno gettato le basi per la ricerca cellulare futura.