Nel 1665, pubblicò le sue osservazioni nel suo libro "Micrographia". Ha usato un microscopio per esaminare una sottile fetta di sughero e ha osservato piccoli compartimenti che ha chiamato "cellule" perché gli hanno ricordato le piccole stanze in cui vivevano i monaci.
Mentre Hooke stava osservando le cellule morte, il suo lavoro ha spianato la strada allo sviluppo della teoria cellulare, che afferma che tutti gli organismi viventi sono costituiti da cellule.