1. Record fossile: I fossili forniscono un record diretto della vita in passato. Mostrano una progressione di organismi nel tempo, con fossili più vecchi generalmente più semplici di quelli più recenti. Ciò supporta l'idea di cambiamenti graduali e discesa con la modifica. Inoltre, i fossili di transizione (come Archeopteryx, che hanno caratteristiche di rettili e uccelli) mostrano legami evolutivi tra diversi gruppi.
2. Anatomia comparativa: Le somiglianze anatomiche tra specie diverse suggeriscono antenati comuni. Ad esempio, la struttura ossea di un braccio umano, un'ala di pipistrello, una pinna per balene e una gamba di cavallo sono notevolmente simili, anche se queste strutture svolgono funzioni diverse. Ciò è spiegato dalla discesa da un antenato comune con una struttura scheletrica simile.
3. DNA e biologia molecolare: Il codice genetico (DNA) è universale in tutte le forme di vita, suggerendo un'origine comune. Il confronto tra sequenze di DNA tra specie diverse ci consente di ricostruire le relazioni evolutive e stimare quanto siano strettamente correlate. Inoltre, la presenza di geni omologhi (geni con sequenze simili in diverse specie) supporta ulteriormente l'idea di antenati condivisi e cambiamenti evolutivi.