Ecco una rottura:
* Nucleo: I procarioti hanno un singolo cromosoma circolare situato in una regione chiamata nucleoide, ma non è racchiuso in una membrana come il nucleo delle cellule eucariotiche.
* Organelli: I procarioti mancano dei complessi sistemi di membrana interna e organelli che si trovano nelle cellule eucariotiche, come mitocondri, apparati del Golgi, reticolo endoplasmatico, ecc.
Pertanto, i procarioti sono più semplici nella struttura degli eucarioti.