Proteine strutturali:
* istoni: Queste sono le proteine primarie responsabili dell'imballaggio del DNA nella cromatina, la forma compatta in cui esiste il DNA all'interno del nucleo. Formano ottameri (8 complessi proteici) attorno ai quali il DNA si avvolge, formando nucleosomi, i mattoni di base della cromatina. Esistono diversi tipi di istoni, tra cui H1, H2A, H2B, H3 e H4.
* Proteine dell'impalcatura: Questi aiutano a organizzare e piegare la cromatina in strutture di ordine superiore, come loop e rosette. Esempi includono proteine topoisomerasi II e SMC.
Proteine di replicazione:
* DNA polimerasi: Questi enzimi catalizzano la sintesi di nuovi fili di DNA durante la replicazione. Esistono diverse polimerasi di DNA, ognuna con ruoli specifici, tra cui la DNA polimerasi alfa (Iniziazione), il delta (sintesi del filo in ritardo) ed Epsilon (sintesi di filamenti di spicco).
* Elicasi di DNA: Questi srotolano la doppia elica del DNA, separando i due fili per consentire la replica.
* Proteine di legame a filo singolo (SSB): Questi si legano al DNA a singolo filamento, impedendolo di rivivere e mantenerlo accessibile per la replica.
* Ligasi DNA: Questi uniscono frammenti di DNA creando legami fosfodiesterici. Questo è essenziale per unirsi ai frammenti di Okazaki durante la sintesi in ritardo del filo.
* Primase: Questo enzima sintetizza i primer di RNA corti che forniscono un punto di partenza per la DNA polimerasi per iniziare la replica.
Proteine di trascrizione:
* Fattori di trascrizione: Queste proteine regolano il processo di trascrizione del DNA nell'RNA. Possono legarsi a sequenze di DNA specifiche (promotori) e attivare o reprimere la trascrizione dei geni vicini.
* RNA polimerasi: Questo enzima è responsabile della sintesi di molecole di RNA usando il DNA come modello. Esistono diverse polimerasi RNA per diversi tipi di RNA (ad es. RNA polimerasi I per RNA ribosomiale).
* Fattori di trascrizione generali: Questi sono necessari affinché l'RNA polimerasi si leghi al promotore e inizi la trascrizione.
Proteine di riparazione del DNA:
* Enzimi di riparazione del DNA: Queste proteine riparano danni al DNA, che possono verificarsi da varie fonti come radiazioni UV, sostanze chimiche o errori durante la replicazione. Esempi includono:
* Exonucleasi: Questi rimuovono i nucleotidi danneggiati o non corrispondenti.
* Endonuclease: Questi tagli DNA in siti specifici.
* Ligasi DNA: Questi si uniscono alle estremità del DNA dopo la riparazione.
Altre proteine:
* topoisomerasi: Questi enzimi alleviano lo stress torsionale nel DNA durante la replicazione e la trascrizione. Possono tagliare e riprogrammare i fili del DNA per prevenire il supervoca.
* Telomerasi: Questi enzimi estendono le estremità dei cromosomi (telomeri) per prevenire la perdita di informazioni genetiche durante la replicazione.
Questo non è un elenco esaustivo, ma fornisce una buona panoramica dei principali tipi di proteine associate al DNA nella cellula. Ogni proteina svolge un ruolo fondamentale nel mantenere l'integrità, replicare ed esprimere le nostre informazioni genetiche.