Quando si incontra un isolato batterico non caratterizzato, un approccio sistematico che combini microscopia, coltura e metodi molecolari è essenziale per un'identificazione accurata.
Inizia esaminando la composizione, la forma e il modo in cui le cellule si collegano tra loro dopo la divisione. Questi attributi di base forniscono i primi indizi sulla tassonomia dell'organismo.
La colorazione di Gram distingue i batteri con pareti spesse di peptidoglicano (Gram‑positivi) da quelli con pareti sottili o assenti (Gram‑negativi). È la pietra angolare della classificazione batterica.
Si noti che ciascuna forma può essere Gram‑positiva o Gram‑negativa, tranne la spirilla che è esclusivamente Gram‑negativa.
Dopo la divisione, cocchi e bacilli formano disposizioni caratteristiche:
Inoculare l'isolato su una gamma di terreni di crescita che favoriscono o inibiscono specifici gruppi batterici. Osserva la morfologia, il colore e il tasso di crescita delle colonie per restringere le possibilità.
Esaminare i sottoprodotti metabolici (ad esempio ossidasi, catalasi, fermentazione dei carboidrati) per perfezionare ulteriormente l'identificazione. Molti laboratori utilizzano pannelli automatizzati per garantire velocità e precisione.
Se i dati morfologici e biochimici non sono conclusivi, il sequenziamento dell'rRNA 16S o l'analisi dell'intero genoma possono abbinare definitivamente l'isolato a una specie conosciuta o rivelare un nuovo ceppo, a condizione che esistano genomi di riferimento.
Ad esempio, un isolato Gram-negativo, aerobico e che forma catene di bastoncelli diritti potrebbe essere identificato come Escherichia coli dopo la conferma della coltura e del sequenziamento.
Sergej Nazarov/iStock/GettyImages
