Il dolce, le patate dolci amidacee all'arancia sono ingredienti gustosi e nutrienti per patatine fritte, sformati e torte. Sebbene gli esseri umani coltivino patate dolci da migliaia di anni, gli scienziati non sanno ancora molto sulla composizione proteica di questi tuberi. nell'ACS' Journal of Proteome Research , i ricercatori hanno analizzato il proteoma delle foglie e delle radici della patata dolce, e nel processo, hanno rivelato nuove informazioni sul genoma della pianta.

La patata dolce ( Ipomoea batatas , Lam.) è un alimento base in alcune parti del mondo, oltre ad essere utilizzato per mangimi e prodotti industriali, come i biocarburanti. La pianta ha un genoma sorprendentemente complesso, codificare più geni predetti rispetto al genoma umano. La patata dolce ha anche una composizione chimica complessa, con un basso contenuto proteico nelle radici (la parte che le persone mangiano) e molti metaboliti secondari nelle foglie, rendendo difficile l'estrazione di quantità sufficienti di proteine ​​per l'analisi. Sorina e George Popescu e colleghi volevano vedere se un approccio "proteogenomico" - l'analisi congiunta di dati genetici e proteici - potesse aiutarli a comprendere meglio le composizioni delle radici e delle foglie della patata dolce.

Il team ha estratto le proteine ​​da campioni di radici e foglie utilizzando due metodi diversi e le ha tagliate in peptidi, che hanno analizzato con cromatografia liquida e spettrometria di massa. I ricercatori hanno identificato 3, 143 proteine ​​uniche da foglie di patata dolce e 2, 928 dalle radici. Quando hanno confrontato i dati proteomici con il genoma della patata dolce, hanno identificato alcune regioni nella sequenza del genoma pubblicata in cui i loro dati potrebbero fornire informazioni avanzate. Per esempio, l'analisi ha previsto 741 nuove regioni codificanti proteine ​​che in precedenza non si pensava fossero geni. Il gruppo afferma che i risultati potrebbero essere utilizzati per aiutare a caratterizzare ulteriormente e biofortificare il tubero.