Struttura del SUP anionico, dispositivi per misurazioni di conducibilità protonica e prestazioni di diversi SUP in questi dispositivi. (A) Struttura primaria dei SUP progettati con varie densità di carica. (B) Protocollo di fabbricazione di film proteici depositati su IDE d'oro. (C) Misurazione dell'impedenza del campione E72 a forma di diagramma di Nyquist sotto diversa RH. La figura (ii) è la regione di ingrandimento di (i) indicata dal quadrato blu. (D) Grafico di Nyquist di film sottili di proteine dai campioni E72, HC_E35, e DC_E108 equilibrato a RH =90%. L'intercetta estrapolata del semicerchio osservato con l'asse x è indicativa della resistenza del campione che scala come HC_E35> E72> DC_E108. Credito:progressi scientifici, doi:10.1126/sciadv.abc0810
I protoni sono particelle subatomiche con carica elettrica positiva. La traslocazione di protoni svolge un ruolo significativo nei fenomeni naturali e nelle tecnologie create dall'uomo. Ma rimane difficile controllare la conduzione e la fabbricazione dei protoni nei biomateriali e nei dispositivi. In un nuovo rapporto, Chao Ma e un team interdisciplinare di scienziati in Cina, Paesi Bassi, e Germania, materiali costituenti proteici conduttori di protoni progettati razionalmente che hanno superato i sistemi proteici (costituiti o contenenti proteine) precedentemente riportati. Hanno sviluppato le strutture attraverso l'esplorazione graduale di sequenze peptidiche da bobine intrinsecamente disordinate a chimere polipeptidiche sovraccaricate di proteine. Il nuovo paradigma di progettazione offre il potenziale per la fabbricazione di dispositivi bioprotonici alle interfacce di sistemi artificiali e biologici, i risultati sono pubblicati su Progressi scientifici .
La conduzione protonica è responsabile di processi fondamentali in biologia, compresa la bioluminescenza, la sintesi di adenosina 5'-trifosfato (ATP) e la traslocazione di protoni innescata dalla luce. Bioingegneri e scienziati dei materiali avevano precedentemente sviluppato diversi materiali sintetici con comportamento di traslocazione protonica, inclusi sistemi ibridi, sebbene le loro carenze abbiano ostacolato i campi della bioelettronica e della biotecnologia. Per sviluppare biomateriali dedicati alla conduzione protonica, gli scienziati devono esplorare scaffold e sequenze per il loro comportamento intrinseco di conduzione protonica. Durante gli stati idratati, i protoni possono essere trasportati tramite molecole d'acqua lungo una rete di legami adiacenti in un meccanismo noto come salto di protoni, che viene utilizzato come progetto per progettare strutture conduttrici di protoni de novo (cioè da zero). In questo lavoro, Ma et al. sviluppato un graduale, membrana a conduzione protonica a base di proteine con una serie di polipeptidi anionici sovralimentati (SUP) contenenti residui di acido glutammico.
Film proteici su substrati e caratterizzazione via SEM e AFM. (A) Procedura schematica per la preparazione di film polipeptidici e proteici a conduzione protonica mediante la tecnica di colata a goccia utilizzata in questo studio. (B) Immagini di microscopia elettronica a scansione (SEM) che mostrano la morfologia piatta e omogenea del nostro film sottile personalizzato (qui E72 è mostrato come esempio) sugli elettrodi. Il bordo frastagliato sul lato sinistro di a) è la posizione di troncatura per l'imaging della sezione trasversale in b). (C) Immagine AFM di una superficie di film sottile graffiata (in alto) e il suo profilo di altezza corrispondente (in basso). L'esempio E72 è mostrato qui come esempio. Credito:progressi scientifici, doi:10.1126/sciadv.abc0810
Nella spina dorsale polipeptidica della membrana conduttrice di protoni, le frazioni cariche idrofile (amanti dell'acqua) servivano come portatori di protoni. Il team ha studiato le prestazioni di conduzione protonica di questi sistemi dispiegati per ottenere membrane indipendenti e ha perfezionato il design strutturale amalgamando strutture di fogli simili alla seta con SUP anionici per formare nanostrutture autoassemblate. Il team ha decorato le superfici con densi gruppi di acido carbossilico per l'idratazione, dissociazione protonica e per formare vie di conduzione protonica. La membrana meccanicamente stabile e indipendente ha superato le proprietà di trasporto finora riportate dei sistemi a base di proteine per un'eccezionale conduttività protonica.
Il team ha derivato le proteine sovralimentate dall'elastina; esplorato in precedenza per applicazioni di ingegneria proteica e modifica dell'interfaccia. Introdussero l'acido glutammico (abbreviato Glu o E), che può essere facilmente deprotonato in condizioni fisiologiche nel sito X della sequenza proteica, per formare polipeptidi non strutturati sovralimentati negativamente (SUP-E). Quindi hanno costruito tre diverse varianti di polipeptidi sovralimentati noti come E72, HC_E35 e DC_E108. Ma et al. ha utilizzato la spettroscopia di impedenza elettrochimica (EIS) con elettrodi interdigitati in oro (IDE) per valutare la conduzione di protoni a film sottile e il trasporto di protoni misurato in funzione dell'umidità relativa. Quando l'umidità è aumentata al 90%, la traslocazione protonica è migliorata grazie all'assorbimento di un gran numero di molecole d'acqua attraverso i gruppi di acido carbossilico (-COOH) del materiale. Oltre all'umidità relativa, hanno anche studiato la conduzione protonica relativa alla densità dei portatori di carica per i campioni di interesse. Regolando la densità di carica delle proteine disordinate, Ma et al. ha controllato con successo il comportamento della conduttanza protonica delle proteine all'interno dei film. A causa dell'elevata stabilità e uniformità dei film sottili costituiti da SUP, la messa a punto non ha mostrato segni di difetti.
-30GFP sovralimentato composto da una piegatura a botte nanoscopica per conduzione protonica. (A) Struttura 3D di -30GFP sovralimentato con eccessivi acidi glutammico/aspartico (in rosso) sulla superficie della proteina. Il fumetto di sinistra visualizza la struttura in modalità superficie, mostrando i residui positivi in blu e quelli negativi in rosso. Il cartone a destra visualizza il -30GFP come un diagramma a nastro che presenta esclusivamente cariche negative. (B) Misurazione dell'impedenza del campione -30GFP (punti solidi giallastri) nel tracciato di Nyquist al 90% di umidità relativa, rispetto ad altri campioni di SUP. (C) Confronto di conduttanza tra i campioni E72, HC_E35, DC_E108, e -30GFP (**P =0,004, n> 3). (D) Pattern GIXD per lo studio della struttura dei diversi film. Sono stati osservati due segnali distinti per il -30GFP nanostrutturato (a sinistra), mentre non è stato rilevato alcun segnale per i film E72 (a destra), indicando la sua natura non strutturata. Credito:progressi scientifici, doi:10.1126/sciadv.abc0810
Ma et al. poi ha studiato ulteriormente le ossature proteiche piegate in nanodimensioni e ha dotato gli scaffold su nanoscala di acido carbossilico sulla superficie, simile ai SUP. Utilizzando la diffrazione dei raggi X, hanno studiato le informazioni strutturali all'interno dei campioni di proteine sovralimentate per ottenere firme distinte dei loro domini strutturali, per mostrare come i componenti nanostrutturati potrebbero facilitare la traslocazione di protoni. Il lavoro ha permesso al team di ingegnerizzare razionalmente motivi proteici per eseguire la conduzione protonica. Motivato da una maggiore conduttività protonica, Ma et al. combinato gli elementi di progettazione risultanti con le strutture esistenti di polipeptidi sovralimentati (SUP).
Invece di utilizzare motivi a -barile nell'architettura dei materiali, hanno usato le strutture a fogli β meccanicamente stabili, una sequenza ottenuta dalla seta di ragno. Hanno chiamato il sistema combinato di SUP anionico con sequenze di fogli come "ragno-E". The scientists produced the recombinant anionic spider-E material using plasmid-vector expression systems in the lab and determined the structure using X-ray diffraction, Fourier transform infrared (FTIR) spectroscopy and atomic force microscopy. The spider-E film showed higher proton conductance compared to amorphous SUP films alone.
Sequence, struttura, and proton conduction of recombinant supercharged spider-E thin films on IDE. (A) Rationally designed supercharged spider silk–inspired proteins (spider-E). The spider motif contains a poly-A sequence (green) and anionic supercharged regions (red) that are forming the loops between the rigid β sheets. (B) Structure analyses of the spider-E supported film. Two peaks were detected by GIXD, indicating the characteristic intersheet and interstrand distances, rispettivamente. (C) FTIR characterization of the films indicate random coils for the E72 sample (gray dashed line) with an amide I peak located at 1640 cm−1 and a shift to a typical β sheet amide I peak for the spider-E sample (red solid line) at 1620 cm−1. (D) Morphology analyses of the spider-E supported film. Quantification of the nanostructures assembled through spider β sheet domains by AFM. This sample was obtained by extensive swelling of the film by water contact to induce separation between the domains. (E) Nyquist plots obtained at RH =90% for the five genetically engineered samples including spider-E. The impedance curve of the spider-E sample shows the lower resistance value among all the samples (red). (F) Comparison of conductance of the resulting devices demonstrating the stepwise increase in the transport properties due to the improved protein design. The proton transport of spider-E thin films on IDEs is noticeably higher than HC_E35 (***P =0.0009, n> 3) and DC_E108 (*P =0.0155, n> 3). Credito:progressi scientifici, doi:10.1126/sciadv.abc0810
The β-sheet structured material system showed improved mechanical properties as a free-standing membrane that could be easily produced. Ad esempio, Ma et al. drop casted the spider-E solution to engineer a transparent macroscopic membrane in the lab. The results showed mechanical robustness of the construct due to the inclusion of spider motifs with a yield strength comparable to recombinant spider silk materials. The researchers showed how spider motifs formed β-sheet structured domains with hydrophilic surfaces composed of glutamic acid-rich SUP strands, to facilitate excellent proton hopping. The study pushed the limits of existing proteinaceous proton-conducting materials to represent a key example of protein engineering. The work represents one of the first examples that combines protein engineering and the rational design of bulk architecture with collective properties from molecular ensembles.
Bulk freestanding chimeric spider-E membrane with extraordinary proton transfer properties. (A) A digital photograph illustrates the dimensions and transparency of the membrane. The protein membrane is clamped with a fine tweezer. Photo credit:Chao Ma, University of Groningen. (B) Mechanical characterization of the freestanding (FS) protein membrane, showing a typical tensile stretching curve. (C) Nyquist plot illustrating the conductance behavior of the FS spider-E membrane under different RHs. The film shows best proton translocation properties at 90% RH. (D) AFM characterization of the FS spider-E membrane under ~30 and ~90% RH conditions. Barre della scala, 100 nanometri. Blue arrows point at distinguishable nanostructures. (E) Proposed mechanism of proton transport in the spider-E membrane at RH =90%. The protons hop between water molecules nanoconfined in the hydrated network of nanodomains formed by spider β sheet motifs (in green). The glutamic acid residues in the chimeric nanostructures present carboxylic groups (in red) on the surface, providing the protons and coordinating water molecules. Credito:progressi scientifici, doi:10.1126/sciadv.abc0810
In questo modo, Chao Ma and colleagues applied rational molecular de novo design and engineering to achieve a bioinspired protein-derived bulk material with robust properties of proton conduction and excellent mechanical stability. They tested the surface modifications using a range of biophysical tools. The team developed the new generation, bioinspired bulk material and explored successive sequence designs to offer a promising platform for applications in biotechnology and envision the use of such materials for proton transport in miniaturized biofuel cells of the future.
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