Scoperta di farmaci basata su frammenti (FBDD) offre ai ricercatori un approccio efficiente per accedere a molecole complesse per la scoperta di farmaci. Questa tecnica prevede l'identificazione di piccole molecole bioattive note come frammenti che si legano a una specifica proteina bersaglio. Questi frammenti servono come punto di partenza per lo sviluppo di candidati farmaci più grandi e potenti. L'FBDD utilizza una varietà di tecniche, tra cui la cristallografia a raggi X, la spettroscopia di risonanza magnetica nucleare (NMR) e metodi computazionali, per identificare i frammenti che si legano alla proteina bersaglio. Una volta identificati, questi frammenti possono essere modificati chimicamente e combinati per generare molecole più grandi e complesse che mantengono le proprietà leganti desiderate. Questo processo iterativo consente ai ricercatori di esplorare in modo efficiente un vasto spazio chimico e identificare farmaci candidati promettenti per un ulteriore sviluppo.

Passaggi chiave nella scoperta di farmaci basati su frammenti (FBDD):

Selezione destinazione:

- Identificare un bersaglio proteico rilevante per la malattia per la scoperta di farmaci.

Progettazione della libreria di frammenti:

- Genera una libreria diversificata di piccole molecole simili a farmaci, note come frammenti, utilizzando la chimica combinatoria o metodi computazionali.

Screening dei frammenti:

- Analizzare la libreria di frammenti rispetto alla proteina bersaglio utilizzando tecniche biofisiche come la cristallografia a raggi X o la spettroscopia NMR.

Analisi dei risultati dei frammenti:

- Analizzare le modalità di legame e le affinità dei frammenti per identificare potenziali punti di partenza per la progettazione di farmaci.

Elaborazione del frammento:

- Modificare e combinare chimicamente i frammenti colpiti per generare molecole più grandi e complesse che mantengano le proprietà leganti desiderate.

Studi sulle relazioni struttura-attività (SAR):

- Eseguire studi SAR per ottimizzare la potenza e la selettività delle molecole derivate dai frammenti.

Ottimizzazione dei lead:

- Ottimizzare ulteriormente i composti guida attraverso cicli iterativi di progettazione, sintesi e test per migliorarne le proprietà simili ai farmaci.

Sviluppo preclinico e clinico:

- Valutare la sicurezza e l'efficacia dei composti ottimizzati negli studi preclinici e far avanzare i candidati promettenti negli studi clinici.