I sistemi salini che generano cloro possono causare incrostazioni nelle piscine, ovvero l'accumulo di calcio e altri minerali sulle superfici della piscina. Ciò può essere antiestetico e può anche danneggiare l'attrezzatura della piscina. È possibile prevenire la formazione di calcare utilizzando un addolcitore d'acqua o aggiungendo un inibitore del calcare all'acqua della piscina.

Corrosione

Il cloro generato dai sistemi a sale può anche causare la corrosione dei componenti metallici della piscina, come il riscaldatore, il filtro e la pompa. Ciò può comportare riparazioni costose. La corrosione può essere prevenuta utilizzando un inibitore di corrosione o mediante protezione catodica.

Clorammine

Il cloro generato dai sistemi salini può reagire con i composti dell'azoto presenti nell'acqua della piscina per formare clorammine. Le clorammine non sono efficaci nell'uccidere i batteri quanto il cloro e possono anche causare irritazione alla pelle e agli occhi. Le clorammine possono essere rimosse utilizzando un ossidante chimico o mediante luce ultravioletta (UV).

PH basso

I sistemi salini che generano cloro possono anche abbassare il pH dell’acqua della piscina. Ciò può rendere l'acqua corrosiva e causare irritazioni alla pelle e agli occhi. Il pH basso può essere corretto aggiungendo un aumentatore di pH all’acqua della piscina.