L'etere è un solvente altamente infiammabile e volatile e l'utilizzo della filtrazione in aspirazione con etere può creare una situazione pericolosa a causa del rischio di ignizione. L'aspirazione applicata durante la filtrazione può creare elettricità statica, che può accendere i vapori dell'etere. Inoltre, i vapori di etere possono formare perossidi esplosivi in seguito all'esposizione all'aria e alla luce.
Invece della filtrazione per aspirazione, per le soluzioni contenenti etere si dovrebbero prendere in considerazione altri metodi come la filtrazione per gravità o la filtrazione utilizzando un imbuto Büchner con carta da filtro. Questi metodi non prevedono l'uso dell'aspirazione e sono quindi più sicuri per solventi infiammabili come l'etere.
